Ci avevo pensato (al problema), ma non diciamo proprio la stessa cosa, tu parli di "due vertici" dando per scontato che si tratti dei vertici corrispondenti all'edge tagliato. Io parlavo invece dei "vertici più vicini", quindi un set di vertici: in certi casi potrebbe essere più sensato prendere le dipendenze da un vertice vicino appartenente a un altro edge o addirittura a un altro triangolo.
In ogni caso non è che cambi moltissimo.
In entrambi i casi, il fatto che le bones possano essere diverse non mi preoccupa. Da parecchio tempo ormai un vertice non deve dipendere da una sola bone, quindi, nel caso "semplice" di due vertici soltanto, se abbiamo V1 dipendente da b1 e V2 dipendente da b2, V3 avrà due pesi, uno per ogni bone: dove sbaglio? Ovviamente il processing di _quel_ vertice sarà più calcoloso, ma in compenso hai tagliato via N vertici del braccio o della testa, per cui chissene...
Il problema si pone, più che altro, se V1 dipende da due bones b1 e b2 e V2 dipende da b3 e b4: in questo caso, se il sistema supporta solo due bones per vertice, dovrai fare una scelta: basterà togliere dalle dipendenze le due bones che influivano di meno.
In sostanza, però, alla fine sono d'accordo con la conclusione del sangue e dello schifo, ma per motivi di design... questo se penso a un corpo di zombie martoriato. Se invece si tratta di tutt'altro... boh... potrebbe essere un tubo tagliato a metà? Anche lì la parte tagliata non dovrebbe per forza essere perfetta... non me lo aspetterei.
Cmq, come dici tu: bisogna provare.